Laboratorio a Moirago
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Aperto ora
Residenza Sassi, 941, 20080 Basiglio
333 397 0569
Web app per svolgere in modo intuitivo l'analisi dei dati di sequenziamento NGS da esperimenti di meta-barcoding del gene codificante per rRNA 16S relativi al microbioma batterico. Permette di eseguire una pipeline di analisi basata sul pacchetto Qiime2 con visualizzazione integrata dei risultati. Permette sia l'analisi secondaria dei dati grezzi (file fastq. gz da tecnologia MiSeq Illumina) per ottenere tabelle delle conte normalizzate delle OTUs/ASVs (Operational Taxonomic Units/Amplicon Sequence Variants) e della classificazione tassonomica, sia l'analisi terziaria delle tabelle di OTUs e tassonomia ed eventuali metadati per ottenere metriche di alfa e beta diversità e abbondanze relative dei taxa con figure pronte per la pubblicazione. 